Avec l'élargissement du mandat de l'ACBF en 1999, la Fondation a appuyé les organisations faîtières de la société civile et du secteur privé. L’ACBF a renforcé les capacités des acteurs non étatiques dans le plaidoyer, l'autonomisation des femmes, la gouvernance, le leadership et la résolution des conflits tant au niveau national que régional. Au niveau national, l’appui de l'ACBF est donné à travers des projets d'interface pour renforcer les capacités des acteurs non étatiques afin qu’ils participent au dialogue sur les politiques nationales en vue de la réalisation des objectifs de développement des pays. La Fondation, dans son appui aux acteurs non étatiques, a pris la décision stratégique de cibler non seulement les organisations faîtières, mais surtout les organisations faîtières des femmes afin de mettre les questions de genre au centre du renforcement des capacités et de favoriser le dialogue tripartite nécessaire entre le secteur public, le secteur privé et les organisations non gouvernementales qui facilitent les efforts de développement concertés et aboutissent à l’accroissement de la responsabilisation.
Voici les projets et institutions de renforcement des capacités des acteurs non-étatiques appuyés par l'ACBF depuis son premier plan stratégique à moyen terme :
- Alliance de l'initiative des maires pour l'action communautaire contre le VIH/SIDA au niveau local (AMICAALL, Swaziland)
- Conseil botswanais des organisations non gouvernementales (BOCONGO)
- Renforcement institutionnel de l'Assemblée de coordination des organisations non gouvernementales (CANGO)
- Projet de renforcement des capacités des réseaux des femmes pour la lutter contre la pauvreté en République du Cameroun (CAREF)
- Centre de Formation des Acteurs Locaux (CIFAL)
- Centre pour la gouvernance d'entreprise (GCC, Kenya)
- Projet de Centre National d'Appui aux Organisations de Femmes du Gabon (CENAF, Gabon)
- Coordination des Organisations Non-Gouvernementales Féminines Nigériennes (CONGAFEN, Niger)
- Projet de renforcement des capacités de l’interface de l’Institut pour la gouvernance démocratique (IDEG-CAP, Ghana)
- Comité de coordination des organisations non gouvernementales (NGOCC, Zambie)
- Projet d'Appui au renforcement des capacités des Organisations de la Société Civile et à l'interface au Tchad (PARCOSIT, Tchad)
- Projet de renforcement des capacités des structures d'encadrement, de Promotion du Secteur Privé, et des Réseaux des Organisations Féminines de la Société Civile, (CASPOF) République Démocratique du Congo (CASPOF)
- Projet de renforcement de l'interface Etat - Secteur Privé-Société Civile (PARECAP, Burkina Faso)
- Projet de renforcement de Capacités des Femmes de l'Afrique de l'Ouest (PRC AFAO)
- RENFORCEMENT des Capacités des Organisations Féminines du Mali (RECOFEM)
- Projet de renforcement des Capacités de la Société Civile Dans la Prévention et la Gestion des Conflits en Afrique Centrale (PREGESCO, RDC (régional)
- Projet pour le renforcement de l'Interface Entre les Etats et Chambres d'Agriculture de l'Afrique de l'Ouest PRIECA / AO, Sénégal (régional))
- Projet de renforcement de l'Interface Entre l'Etat et le Secteur Privé (PRIESP, Mali)
- Projet de renforcement des Capacités de la Société Civile et du Secteur Privé Pour le Dialogue Interpartenariat en République du Congo (RECADIP, Congo Brazzaville)
- Coalition des Organisation non gouvernementales sud-africaines (SANGOCO, Afrique du Sud)
- Association des organisations non gouvernementales de la Gambie (TANGO, Gambie)
- Association des journalistes d'Afrique de l'Ouest (UJAO, Mali (régionale))